MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Staphylococcus aureus subsp. aureus Mu50 plasmid VRSAp

Total Repeats: 549

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_002774	TAT	2	6	311	316	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	14141824
2	NC_002774	ATTT	2	8	382	389	25 %	75 %	0 %	0 %	14141824
3	NC_002774	TATG	2	8	431	438	25 %	50 %	25 %	0 %	14141824
4	NC_002774	TTA	2	6	441	446	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	14141824
5	NC_002774	AATG	2	8	474	481	50 %	25 %	25 %	0 %	14141824
6	NC_002774	ATA	3	9	493	501	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	14141824
7	NC_002774	TAA	2	6	518	523	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	14141824
8	NC_002774	TG	3	6	529	534	0 %	50 %	50 %	0 %	14141824
9	NC_002774	A	6	6	556	561	100 %	0 %	0 %	0 %	14141824
10	NC_002774	A	7	7	572	578	100 %	0 %	0 %	0 %	14141824
11	NC_002774	TAA	2	6	583	588	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	14141824
12	NC_002774	AATTT	2	10	589	598	40 %	60 %	0 %	0 %	14141824
13	NC_002774	TAA	2	6	623	628	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	14141824
14	NC_002774	ACT	2	6	889	894	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	14141824
15	NC_002774	ATG	2	6	907	912	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	14141824
16	NC_002774	GAA	2	6	936	941	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	14141824
17	NC_002774	TTA	2	6	997	1002	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	14141824
18	NC_002774	TTA	2	6	1011	1016	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	14141824
19	NC_002774	CAA	2	6	1034	1039	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	14141824
20	NC_002774	ATT	2	6	1054	1059	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	14141824
21	NC_002774	AGA	2	6	1064	1069	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	14141824
22	NC_002774	A	7	7	1123	1129	100 %	0 %	0 %	0 %	14141824
23	NC_002774	TAA	2	6	1202	1207	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	14141824
24	NC_002774	ACG	2	6	1208	1213	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	14141824
25	NC_002774	CTT	2	6	1231	1236	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	14141824
26	NC_002774	AAT	2	6	1246	1251	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	14141824
27	NC_002774	TCT	2	6	1744	1749	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	14141825
28	NC_002774	TGC	2	6	1772	1777	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	14141825
29	NC_002774	TTA	2	6	1795	1800	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	14141825
30	NC_002774	TCA	2	6	1837	1842	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	14141825
31	NC_002774	TTTA	2	8	1869	1876	25 %	75 %	0 %	0 %	14141825
32	NC_002774	A	6	6	1876	1881	100 %	0 %	0 %	0 %	14141825
33	NC_002774	ACC	2	6	1884	1889	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	14141825
34	NC_002774	TTA	2	6	1894	1899	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	14141825
35	NC_002774	GTT	2	6	1904	1909	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	14141825
36	NC_002774	CTT	2	6	1910	1915	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	14141825
37	NC_002774	T	6	6	1917	1922	0 %	100 %	0 %	0 %	14141825
38	NC_002774	TGTT	2	8	1980	1987	0 %	75 %	25 %	0 %	14141825
39	NC_002774	CAA	2	6	2255	2260	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	14141826
40	NC_002774	A	6	6	2259	2264	100 %	0 %	0 %	0 %	14141826
41	NC_002774	TGA	2	6	2292	2297	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	14141826
42	NC_002774	TA	3	6	2303	2308	50 %	50 %	0 %	0 %	14141826
43	NC_002774	A	6	6	2324	2329	100 %	0 %	0 %	0 %	14141826
44	NC_002774	CTC	2	6	2375	2380	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	14141826
45	NC_002774	AAT	2	6	2446	2451	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	14141826
46	NC_002774	A	6	6	2460	2465	100 %	0 %	0 %	0 %	14141826
47	NC_002774	TTA	2	6	2488	2493	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	14141826
48	NC_002774	AG	3	6	2515	2520	50 %	0 %	50 %	0 %	14141826
49	NC_002774	GAT	2	6	2602	2607	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	14141826
50	NC_002774	AAC	2	6	2611	2616	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	14141826
51	NC_002774	TACT	2	8	2633	2640	25 %	50 %	0 %	25 %	14141826
52	NC_002774	ATG	2	6	2699	2704	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	14141826
53	NC_002774	TAAA	2	8	2723	2730	75 %	25 %	0 %	0 %	14141826
54	NC_002774	TAA	2	6	2736	2741	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	14141826
55	NC_002774	AAG	2	6	2780	2785	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	14141826
56	NC_002774	AATTAA	2	12	2801	2812	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	14141826
57	NC_002774	A	6	6	2882	2887	100 %	0 %	0 %	0 %	14141826
58	NC_002774	AGA	2	6	2910	2915	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	14141826
59	NC_002774	GAAA	2	8	2935	2942	75 %	0 %	25 %	0 %	14141826
60	NC_002774	TTA	2	6	2982	2987	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	14141826
61	NC_002774	AGA	2	6	3010	3015	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	14141826
62	NC_002774	ATT	2	6	3039	3044	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	14141826
63	NC_002774	AGAA	2	8	3056	3063	75 %	0 %	25 %	0 %	14141826
64	NC_002774	ATT	2	6	3084	3089	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	14141826
65	NC_002774	AAGT	2	8	3110	3117	50 %	25 %	25 %	0 %	14141826
66	NC_002774	TATTT	2	10	3138	3147	20 %	80 %	0 %	0 %	14141826
67	NC_002774	GATA	2	8	3148	3155	50 %	25 %	25 %	0 %	14141826
68	NC_002774	GAAA	2	8	3183	3190	75 %	0 %	25 %	0 %	14141826
69	NC_002774	ATG	2	6	3299	3304	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	14141826
70	NC_002774	AGAAA	2	10	3319	3328	80 %	0 %	20 %	0 %	14141826
71	NC_002774	CAA	2	6	3349	3354	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	14141826
72	NC_002774	ACTA	2	8	3376	3383	50 %	25 %	0 %	25 %	14141826
73	NC_002774	GAA	2	6	3402	3407	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	14141826
74	NC_002774	AG	3	6	3421	3426	50 %	0 %	50 %	0 %	14141826
75	NC_002774	ATCA	2	8	3446	3453	50 %	25 %	0 %	25 %	14141826
76	NC_002774	A	7	7	3482	3488	100 %	0 %	0 %	0 %	14141826
77	NC_002774	TCA	3	9	3522	3530	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	14141826
78	NC_002774	ATG	2	6	3539	3544	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	14141826
79	NC_002774	TTG	2	6	3557	3562	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	14141826
80	NC_002774	CAAA	2	8	3615	3622	75 %	0 %	0 %	25 %	14141826
81	NC_002774	ATG	2	6	3638	3643	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	14141826
82	NC_002774	AGA	2	6	3651	3656	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	14141826
83	NC_002774	A	6	6	3664	3669	100 %	0 %	0 %	0 %	14141826
84	NC_002774	GAAAAA	2	12	3760	3771	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	14141826
85	NC_002774	TGA	3	9	3798	3806	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	14141826
86	NC_002774	AAG	3	9	3914	3922	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	14141826
87	NC_002774	TAGA	2	8	3947	3954	50 %	25 %	25 %	0 %	14141826
88	NC_002774	CGAA	2	8	4049	4056	50 %	0 %	25 %	25 %	14141826
89	NC_002774	ATC	2	6	4079	4084	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	14141826
90	NC_002774	AGA	3	9	4091	4099	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	14141826
91	NC_002774	AG	3	6	4104	4109	50 %	0 %	50 %	0 %	14141826
92	NC_002774	AAGT	2	8	4523	4530	50 %	25 %	25 %	0 %	14141827
93	NC_002774	ATT	2	6	4566	4571	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	14141827
94	NC_002774	AATT	2	8	4589	4596	50 %	50 %	0 %	0 %	14141827
95	NC_002774	TAA	2	6	4620	4625	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	14141827
96	NC_002774	T	6	6	4648	4653	0 %	100 %	0 %	0 %	14141827
97	NC_002774	AGG	2	6	4656	4661	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	14141827
98	NC_002774	AAAAAT	2	12	4690	4701	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	14141827
99	NC_002774	CTT	2	6	4705	4710	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	14141827
100	NC_002774	TTG	2	6	4722	4727	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	14141827
101	NC_002774	AAAT	2	8	4808	4815	75 %	25 %	0 %	0 %	14141827
102	NC_002774	AGA	2	6	4933	4938	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	14141828
103	NC_002774	TGG	2	6	5049	5054	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	14141828
104	NC_002774	TGA	2	6	5065	5070	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	14141828
105	NC_002774	ACT	2	6	5176	5181	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	14141829
106	NC_002774	TAT	2	6	5182	5187	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	14141829
107	NC_002774	T	7	7	5270	5276	0 %	100 %	0 %	0 %	14141829
108	NC_002774	ATT	2	6	5336	5341	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	14141829
109	NC_002774	CCA	2	6	5388	5393	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	14141829
110	NC_002774	TTTC	2	8	5563	5570	0 %	75 %	0 %	25 %	14141829
111	NC_002774	ATT	2	6	5579	5584	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	14141829
112	NC_002774	TTTTAT	2	12	5593	5604	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	14141829
113	NC_002774	TTG	2	6	5612	5617	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	14141829
114	NC_002774	CTT	2	6	5618	5623	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	14141829
115	NC_002774	ATT	2	6	5633	5638	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	14141829
116	NC_002774	T	7	7	5637	5643	0 %	100 %	0 %	0 %	14141829
117	NC_002774	T	6	6	5648	5653	0 %	100 %	0 %	0 %	14141829
118	NC_002774	T	7	7	5661	5667	0 %	100 %	0 %	0 %	14141829
119	NC_002774	TAC	2	6	5683	5688	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	14141829
120	NC_002774	T	6	6	5722	5727	0 %	100 %	0 %	0 %	14141829
121	NC_002774	ATT	2	6	5786	5791	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	14141829
122	NC_002774	TTA	3	9	5814	5822	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	14141829
123	NC_002774	T	7	7	5872	5878	0 %	100 %	0 %	0 %	14141829
124	NC_002774	T	6	6	6042	6047	0 %	100 %	0 %	0 %	14141830
125	NC_002774	TAG	2	6	6077	6082	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	14141830
126	NC_002774	ATT	2	6	6096	6101	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	14141830
127	NC_002774	AT	3	6	6106	6111	50 %	50 %	0 %	0 %	14141830
128	NC_002774	AC	3	6	6214	6219	50 %	0 %	0 %	50 %	14141830
129	NC_002774	TTC	2	6	6245	6250	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	14141830
130	NC_002774	T	6	6	6273	6278	0 %	100 %	0 %	0 %	14141830
131	NC_002774	TTC	2	6	6347	6352	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	14141830
132	NC_002774	TTG	2	6	6398	6403	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	14141830
133	NC_002774	TC	3	6	6407	6412	0 %	50 %	0 %	50 %	14141830
134	NC_002774	ATT	2	6	6413	6418	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	14141830
135	NC_002774	TGAT	2	8	6437	6444	25 %	50 %	25 %	0 %	14141830
136	NC_002774	GGGA	2	8	6549	6556	25 %	0 %	75 %	0 %	14141830
137	NC_002774	TC	3	6	6619	6624	0 %	50 %	0 %	50 %	14141830
138	NC_002774	AAT	2	6	6696	6701	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	14141830
139	NC_002774	T	6	6	6722	6727	0 %	100 %	0 %	0 %	14141830
140	NC_002774	ATATA	2	10	6833	6842	60 %	40 %	0 %	0 %	14141831
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278	NC_002774	ATC	2	6	13224	13229	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	14141842
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401	NC_002774	T	6	6	18544	18549	0 %	100 %	0 %	0 %	14141849
402	NC_002774	ACC	2	6	18556	18561	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	14141849
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408	NC_002774	TTA	2	6	18774	18779	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	14141850
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411	NC_002774	ATA	2	6	18828	18833	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	14141850
412	NC_002774	TAAA	2	8	18886	18893	75 %	25 %	0 %	0 %	14141850
413	NC_002774	TAT	2	6	18951	18956	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	14141850
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448	NC_002774	T	6	6	21070	21075	0 %	100 %	0 %	0 %	14141854
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450	NC_002774	ATA	2	6	21137	21142	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	14141854
451	NC_002774	GTT	2	6	21150	21155	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	14141854
452	NC_002774	TA	3	6	21169	21174	50 %	50 %	0 %	0 %	14141854
453	NC_002774	ATTTG	2	10	21202	21211	20 %	60 %	20 %	0 %	14141854
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